Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ep400Q8CHI8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms