Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms