Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms