Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc87Q8CDL9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms