Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms