Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcinQ8CDE2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms