Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Lrif1Q8CDD9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Lrif1Q8CDD9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Lrif1Q8CDD9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Lrif1Q8CDD9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Lrif1Q8CDD9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrif1Q8CDD9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Lrif1Q8CDD9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Lrif1Q8CDD9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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