Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ephb1Q8CBF3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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