Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB27

Yod1, Ubiquitin thioesterase OTU1, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yod1Q8CB27 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Yod1Q8CB27 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Yod1Q8CB27 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms