Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Podxl2Q8CAE9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Podxl2Q8CAE9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms