Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
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Atg4aQ8C9S8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Atg4aQ8C9S8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Atg4aQ8C9S8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Atg4aQ8C9S8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Atg4aQ8C9S8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4aQ8C9S8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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