Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8C1R3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms