Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ccser1Q8C0C4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccser1Q8C0C4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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