Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbbp5Q8BX09 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms