Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdm4aQ8BW72 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdm4aQ8BW72 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdm4aQ8BW72 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kdm4aQ8BW72 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms