Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp38Q8BW70 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms