Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms