Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp43Q8BUM9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp43Q8BUM9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Usp43Q8BUM9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Usp43Q8BUM9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp43Q8BUM9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp43Q8BUM9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Usp43Q8BUM9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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