Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms