Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP56

Pgghg, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgghgQ8BP56 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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PgghgQ8BP56 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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PgghgQ8BP56 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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PgghgQ8BP56 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PgghgQ8BP56 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PgghgQ8BP56 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PgghgQ8BP56 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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PgghgQ8BP56 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PgghgQ8BP56 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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PgghgQ8BP56 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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PgghgQ8BP56 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PgghgQ8BP56 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PgghgQ8BP56 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PgghgQ8BP56 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PgghgQ8BP56 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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