Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c4Q8BMQ2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms