Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms