Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Atg4dQ8BGV9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Atg4dQ8BGV9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Atg4dQ8BGV9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Atg4dQ8BGV9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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