Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms