Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG51

Rhot1, Mitochondrial Rho GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhot1Q8BG51 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhot1Q8BG51 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms