Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpped1Q8BFS6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpped1Q8BFS6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms