Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubp1Q811S7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms