Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfascQ810U3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms