Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms