Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChfrQ810L3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms