Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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