Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cldn34b3Q80ZS5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cldn34b3Q80ZS5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cldn34b3Q80ZS5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cldn34b3Q80ZS5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cldn34b3Q80ZS5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Cldn34b3Q80ZS5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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