Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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IfneQ80ZF2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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IfneQ80ZF2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfneQ80ZF2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfneQ80ZF2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfneQ80ZF2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfneQ80ZF2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfneQ80ZF2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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IfneQ80ZF2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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IfneQ80ZF2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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IfneQ80ZF2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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IfneQ80ZF2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfneQ80ZF2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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IfneQ80ZF2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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IfneQ80ZF2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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IfneQ80ZF2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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IfneQ80ZF2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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IfneQ80ZF2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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IfneQ80ZF2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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IfneQ80ZF2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfneQ80ZF2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms