Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp8Q80YR6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms