Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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Npm2Q80W85 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Npm2Q80W85 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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Npm2Q80W85 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
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Npm2Q80W85 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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Npm2Q80W85 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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Npm2Q80W85 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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Npm2Q80W85 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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Npm2Q80W85 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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Npm2Q80W85 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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Npm2Q80W85 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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Npm2Q80W85 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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Npm2Q80W85 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Npm2Q80W85 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms