Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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