Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttll4Q80UG8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms