Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
NischQ80TM9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NischQ80TM9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms