Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccp110Q7TSH4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms