Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdp1Q7TSG2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms