Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Clec4b1Q7TS58 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Clec4b1Q7TS58 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Clec4b1Q7TS58 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Clec4b1Q7TS58 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Clec4b1Q7TS58 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Clec4b1Q7TS58 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec4b1Q7TS58 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms