Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms