Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim46Q7TNM2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim46Q7TNM2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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