Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stk40Q7TNL3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms