Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms