Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK1

Rfx4, Transcription factor RFX4, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx4Q7TNK1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rfx4Q7TNK1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx4Q7TNK1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx4Q7TNK1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfx4Q7TNK1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx4Q7TNK1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx4Q7TNK1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfx4Q7TNK1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfx4Q7TNK1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx4Q7TNK1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx4Q7TNK1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx4Q7TNK1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx4Q7TNK1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx4Q7TNK1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx4Q7TNK1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms