Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HhipQ7TN16 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HhipQ7TN16 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms