Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tigd3Q7TM95 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms