Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms