Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Higd1cQ76I25 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms